Na tretie kolo projektu Zelená domácnostiam sa čakalo už od februára 2016. Slovenská inovačná a energetická agentúra dodržala svoje slovo a tretiu výzvu naozaj vyhlásila dňa 6. septembra 2016. Síce od dvanástej žiadatelia narazili na nedostupnosť stránky www.zelenadomacnostiam.sk, ale od 13.00 hod bol problém odstránený. Stanislav Jurkovič, vedúci oddelenia komunikácie, informoval: „Okamžite sme zareagovali a aby sme zabezpečili rovnaké podmienky pre všetkých, informovali sme záujemcov, že presúvame spustenie systému na 13. Hod. Odvtedy už bolo možné formulár žiadosti štandardne vyplniť.

Miestami to však vyzeralo ako súťaž „Rýchlejší vyhráva“. Pre veľký záujem boli vyčlenené 4 milióny eur vyčerpané už do pol hodiny od spustenia výzvy.

Tretie kolo bolo určené len pre domácnosti z mimobratislavských krajov. Tí, ktorí neuspeli pretože vyčlenené peniaze sa vyčerpali skôr ako stihli požiadať o príspevok, budú mať možnosť žiadať v ďalších kolách. V pilotnom projekte Zelená domácnostiam bolo na začiatku 45miliónov. Doposiaľ sa rozdelilo menej než 15miliónov. Zvyšok bude agentúra obdobne dávkovať v jednotlivých kolách s menšími rozpočtami.

Termín spustenia v poradí štvrtého kola agentúra ešte nezverejnila, no podľa predbežných informácií má byť určené len pre domácnosti v bratislavskom kraji na nákup a inštaláciu fotovoltických panelov.